MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium sp. JLS chromosome

Total Repeats: 164585

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009077	GGC	2	6	37	42	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009077	ACA	2	6	139	144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_009077	ACG	3	9	147	155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_009077	TTCG	2	8	203	210	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_009077	GTC	2	6	216	221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_009077	CCGACC	2	12	259	270	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	126432614
7	NC_009077	CGT	2	6	296	301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126432614
8	NC_009077	GCC	2	6	324	329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126432614
9	NC_009077	ACGGTG	2	12	343	354	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	126432614
10	NC_009077	GCA	2	6	374	379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126432614
11	NC_009077	CTG	2	6	432	437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126432614
12	NC_009077	ATC	2	6	492	497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126432614
13	NC_009077	GCC	2	6	508	513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126432614
14	NC_009077	GAC	3	9	567	575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126432614
15	NC_009077	CCG	3	9	576	584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126432614
16	NC_009077	CGA	2	6	605	610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126432614
17	NC_009077	CGA	2	6	614	619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126432614
18	NC_009077	GCC	2	6	670	675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126432614
19	NC_009077	GCC	2	6	690	695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126432614
20	NC_009077	GTT	2	6	824	829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126432614
21	NC_009077	CTG	2	6	864	869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126432614
22	NC_009077	TCA	2	6	952	957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126432614
23	NC_009077	CGA	2	6	968	973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126432614
24	NC_009077	CGT	2	6	982	987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126432614
25	NC_009077	TGC	2	6	1015	1020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126432614
26	NC_009077	CGA	2	6	1025	1030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126432614
27	NC_009077	AAGG	2	8	1050	1057	50 %	0 %	50 %	0 %	126432614
28	NC_009077	TTC	2	6	1071	1076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126432614
29	NC_009077	TCC	2	6	1122	1127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126432614
30	NC_009077	GCC	2	6	1133	1138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126432614
31	NC_009077	GGA	2	6	1157	1162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126432614
32	NC_009077	GCC	2	6	1208	1213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126432614
33	NC_009077	AAG	2	6	1245	1250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126432614
34	NC_009077	CGA	2	6	1277	1282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126432614
35	NC_009077	CAG	2	6	1301	1306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126432614
36	NC_009077	CAA	2	6	1370	1375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126432614
37	NC_009077	TCGC	2	8	1392	1399	0 %	25 %	25 %	50 %	126432614
38	NC_009077	TGC	2	6	1408	1413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126432614
39	NC_009077	ATCTC	2	10	1417	1426	20 %	40 %	0 %	40 %	126432614
40	NC_009077	GCC	2	6	1467	1472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126432614
41	NC_009077	CCG	2	6	1474	1479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126432614
42	NC_009077	GAA	2	6	1646	1651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126432614
43	NC_009077	CGC	2	6	1674	1679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126432614
44	NC_009077	CAC	2	6	1706	1711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126432614
45	NC_009077	GC	3	6	1724	1729	0 %	0 %	50 %	50 %	126432614
46	NC_009077	CGT	2	6	1741	1746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_009077	T	7	7	1750	1756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009077	GCC	2	6	1768	1773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_009077	CGG	2	6	1784	1789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_009077	A	6	6	1822	1827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009077	TCAC	2	8	1852	1859	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_009077	CGT	2	6	1934	1939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_009077	CCGC	2	8	1956	1963	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
54	NC_009077	GTCC	2	8	1966	1973	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_009077	GCC	2	6	1977	1982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_009077	TC	3	6	2065	2070	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_009077	TCT	2	6	2077	2082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_009077	AC	3	6	2102	2107	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_009077	CGT	2	6	2125	2130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_009077	CGAT	2	8	2153	2160	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_009077	GGT	2	6	2191	2196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009077	GTC	2	6	2215	2220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_009077	GTG	2	6	2309	2314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126432615
64	NC_009077	CGA	2	6	2316	2321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126432615
65	NC_009077	CGG	2	6	2322	2327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126432615
66	NC_009077	TGC	2	6	2436	2441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126432615
67	NC_009077	CGA	3	9	2449	2457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126432615
68	NC_009077	TGT	2	6	2556	2561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126432615
69	NC_009077	CGA	2	6	2701	2706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126432615
70	NC_009077	GCC	2	6	2762	2767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126432615
71	NC_009077	CGA	2	6	2773	2778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126432615
72	NC_009077	GGC	2	6	2836	2841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126432615
73	NC_009077	ACCG	2	8	2843	2850	25 %	0 %	25 %	50 %	126432615
74	NC_009077	CGA	2	6	2883	2888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126432615
75	NC_009077	GGC	2	6	2941	2946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126432615
76	NC_009077	CTG	2	6	3017	3022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126432615
77	NC_009077	GCA	2	6	3045	3050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126432615
78	NC_009077	CTG	2	6	3092	3097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126432615
79	NC_009077	CGA	2	6	3120	3125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126432615
80	NC_009077	TGG	2	6	3168	3173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126432615
81	NC_009077	CGA	2	6	3208	3213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126432615
82	NC_009077	CCG	2	6	3228	3233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126432615
83	NC_009077	CGA	2	6	3238	3243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126432615
84	NC_009077	GAG	2	6	3257	3262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126432615
85	NC_009077	ACG	2	6	3371	3376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126432615
86	NC_009077	TCC	2	6	3393	3398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126432615
87	NC_009077	CGG	2	6	3402	3407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126432615
88	NC_009077	CGA	2	6	3409	3414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126432615
89	NC_009077	CGG	2	6	3421	3426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126432615
90	NC_009077	GACCG	2	10	3498	3507	20 %	0 %	40 %	40 %	126432615
91	NC_009077	TGG	2	6	3542	3547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126432616
92	NC_009077	GTC	2	6	3604	3609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126432616
93	NC_009077	TCGC	2	8	3646	3653	0 %	25 %	25 %	50 %	126432616
94	NC_009077	GTG	2	6	3685	3690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126432616
95	NC_009077	GTCCG	2	10	3705	3714	0 %	20 %	40 %	40 %	126432616
96	NC_009077	CACG	2	8	3717	3724	25 %	0 %	25 %	50 %	126432616
97	NC_009077	TCGC	2	8	3736	3743	0 %	25 %	25 %	50 %	126432616
98	NC_009077	CGG	2	6	3777	3782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126432616
99	NC_009077	CGCA	2	8	3809	3816	25 %	0 %	25 %	50 %	126432616
100	NC_009077	CGG	2	6	3864	3869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126432616
101	NC_009077	CGG	2	6	3906	3911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126432616
102	NC_009077	CGA	2	6	3912	3917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126432616
103	NC_009077	C	6	6	3960	3965	0 %	0 %	0 %	100 %	126432616
104	NC_009077	CGGA	2	8	3977	3984	25 %	0 %	50 %	25 %	126432616
105	NC_009077	TGA	2	6	4055	4060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126432616
106	NC_009077	GTT	2	6	4083	4088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126432616
107	NC_009077	GCC	2	6	4090	4095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126432616
108	NC_009077	GAG	2	6	4096	4101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126432616
109	NC_009077	GGT	2	6	4149	4154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126432616
110	NC_009077	GCA	2	6	4167	4172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126432616
111	NC_009077	GCT	2	6	4173	4178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126432616
112	NC_009077	GGA	2	6	4194	4199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126432616
113	NC_009077	GAG	2	6	4261	4266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126432616
114	NC_009077	GTGCCG	2	12	4282	4293	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	126432616
115	NC_009077	CG	3	6	4314	4319	0 %	0 %	50 %	50 %	126432616
116	NC_009077	AGG	2	6	4334	4339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126432616
117	NC_009077	CCA	2	6	4346	4351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126432616
118	NC_009077	CGG	2	6	4383	4388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126432616
119	NC_009077	GAG	2	6	4462	4467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009077	GTT	2	6	4474	4479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126432617
121	NC_009077	GC	4	8	4517	4524	0 %	0 %	50 %	50 %	126432617
122	NC_009077	TCG	2	6	4557	4562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126432617
123	NC_009077	CG	4	8	4671	4678	0 %	0 %	50 %	50 %	126432617
124	NC_009077	GTG	2	6	4679	4684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126432617
125	NC_009077	GTG	2	6	4694	4699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126432617
126	NC_009077	CAC	2	6	4735	4740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126432617
127	NC_009077	TGCG	2	8	4809	4816	0 %	25 %	50 %	25 %	126432617
128	NC_009077	CGC	3	9	4868	4876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126432617
129	NC_009077	CGA	2	6	4882	4887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126432617
130	NC_009077	CCA	2	6	4893	4898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126432617
131	NC_009077	TCA	2	6	4944	4949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126432617
132	NC_009077	CGC	2	6	4975	4980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126432617
133	NC_009077	CGC	2	6	5044	5049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126432617
134	NC_009077	GTT	2	6	5059	5064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126432617
135	NC_009077	CG	4	8	5071	5078	0 %	0 %	50 %	50 %	126432617
136	NC_009077	CAC	2	6	5090	5095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126432617
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259	NC_009077	GGCC	2	8	9724	9731	0 %	0 %	50 %	50 %	126432620
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265	NC_009077	TCG	2	6	9822	9827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126432620
266	NC_009077	CG	3	6	9896	9901	0 %	0 %	50 %	50 %	126432620
267	NC_009077	CGA	2	6	9910	9915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126432620
268	NC_009077	CGA	2	6	9943	9948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126432620
269	NC_009077	CCG	2	6	9949	9954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126432620
270	NC_009077	CCG	2	6	9969	9974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126432620
271	NC_009077	CGA	2	6	9988	9993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126432620
272	NC_009077	CGT	3	9	10015	10023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126432620
273	NC_009077	GACC	2	8	10060	10067	25 %	0 %	25 %	50 %	126432620
274	NC_009077	GCG	2	6	10086	10091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126432620
275	NC_009077	GAC	2	6	10124	10129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126432620
276	NC_009077	CTT	2	6	10141	10146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126432620
277	NC_009077	CCAC	2	8	10155	10162	25 %	0 %	0 %	75 %	126432620
278	NC_009077	TTC	2	6	10175	10180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126432620
279	NC_009077	ACC	2	6	10181	10186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126432620
280	NC_009077	GC	3	6	10241	10246	0 %	0 %	50 %	50 %	126432620
281	NC_009077	CTG	2	6	10265	10270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126432620
282	NC_009077	GAA	2	6	10366	10371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126432620
283	NC_009077	CGG	2	6	10405	10410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126432620
284	NC_009077	TCG	2	6	10413	10418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126432620
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286	NC_009077	GAC	2	6	10475	10480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126432620
287	NC_009077	CTG	2	6	10484	10489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126432620
288	NC_009077	CGA	2	6	10528	10533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126432620
289	NC_009077	CG	3	6	10553	10558	0 %	0 %	50 %	50 %	126432620
290	NC_009077	CGA	3	9	10591	10599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126432620
291	NC_009077	CTG	2	6	10601	10606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126432620
292	NC_009077	GTG	2	6	10616	10621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126432620
293	NC_009077	ACCT	2	8	10631	10638	25 %	25 %	0 %	50 %	126432620
294	NC_009077	TGG	2	6	10641	10646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126432620
295	NC_009077	TCGA	2	8	10676	10683	25 %	25 %	25 %	25 %	126432620
296	NC_009077	CCG	2	6	10738	10743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126432620
297	NC_009077	TCG	2	6	10770	10775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126432620
298	NC_009077	GAC	2	6	10778	10783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126432620
299	NC_009077	TGA	2	6	10878	10883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126432620
300	NC_009077	AC	3	6	10899	10904	50 %	0 %	0 %	50 %	126432620
301	NC_009077	CG	3	6	10915	10920	0 %	0 %	50 %	50 %	126432620
302	NC_009077	GGCG	2	8	10930	10937	0 %	0 %	75 %	25 %	126432620
303	NC_009077	CGA	2	6	10945	10950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126432620
304	NC_009077	GAG	2	6	10984	10989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
305	NC_009077	CG	3	6	11024	11029	0 %	0 %	50 %	50 %	126432621
306	NC_009077	AGG	2	6	11043	11048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126432621
307	NC_009077	GGTCG	2	10	11110	11119	0 %	20 %	60 %	20 %	126432621
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312	NC_009077	CGC	2	6	11316	11321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126432621
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314	NC_009077	CGAC	2	8	11429	11436	25 %	0 %	25 %	50 %	126432621
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330	NC_009077	CGG	2	6	11875	11880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
331	NC_009077	GCT	2	6	11940	11945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
332	NC_009077	TCC	2	6	12023	12028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
333	NC_009077	CACGG	2	10	12141	12150	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
334	NC_009077	CGA	2	6	12172	12177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
335	NC_009077	GCG	2	6	12330	12335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126432622
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344	NC_009077	GCG	3	9	12527	12535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126432622
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347	NC_009077	CAC	2	6	12740	12745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
348	NC_009077	CGG	2	6	12782	12787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
349	NC_009077	TCG	2	6	12909	12914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126432623
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353	NC_009077	GCG	2	6	13053	13058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126432623
354	NC_009077	CGA	2	6	13078	13083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126432623
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365	NC_009077	GCCG	2	8	13365	13372	0 %	0 %	50 %	50 %	126432624
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371	NC_009077	GAAT	2	8	13893	13900	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
372	NC_009077	GCA	2	6	14011	14016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126432625
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375	NC_009077	CGA	2	6	14104	14109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126432625
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377	NC_009077	TTC	2	6	14178	14183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126432625
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379	NC_009077	ACCGG	2	10	14304	14313	20 %	0 %	40 %	40 %	126432626
380	NC_009077	CGC	2	6	14318	14323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126432626
381	NC_009077	ACG	2	6	14326	14331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126432626
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383	NC_009077	GC	4	8	14353	14360	0 %	0 %	50 %	50 %	126432626
384	NC_009077	GCCG	2	8	14365	14372	0 %	0 %	50 %	50 %	126432626
385	NC_009077	GT	3	6	14404	14409	0 %	50 %	50 %	0 %	126432626
386	NC_009077	GCC	2	6	14413	14418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126432626
387	NC_009077	GCC	2	6	14431	14436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126432626
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389	NC_009077	CCG	2	6	14466	14471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126432626
390	NC_009077	TGG	2	6	14489	14494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126432626
391	NC_009077	GCA	2	6	14511	14516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126432626
392	NC_009077	CCA	2	6	14571	14576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126432626
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